上海危險品進口清關公司代理手續操作一般包括以下幾個步驟：
1. 提供相關資料：進口合同、發票、裝箱單、提單、危險品申報表、危險品包裝證書、危險品運輸標志等。
2. 報關公司進行資料審核，核對清關所需的手續和文件。
3. 繳納相關費用：包括報關代理費、清關費、商檢費、海關稅費等。
4. 進行危險品檢驗：根據貨物的種類和危險等級，需要進行不同程度的檢驗。
5. 辦理危險品進口許可證：根據貨物的種類和危險等級，需要辦理相應的進口許可證。
6. 辦理海關手續：包括海關查驗、放行等手續。
費用方面，具體費用會根據貨物的種類、數量、價值、危險等級等因素而有所不同，一般來說，報關代理費用在貨物總價值的1%~3%之間，清關費用和其他費用也會根據具體情況而有所不同。
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